Lutte contre la dystrophie musculaire, bientôt la phase 2

Voici son message :

Chers tous,

Nous sommes arrivés au moment du lancement de la deuxième phase du projet Help Cure Muscular Dystrophy (HCMD2). La World Community Grid (WCG) estime que le projet débutera mi-avril 2009. Nous avons, de notre côté, terminé tout ce que l'on souhaitait et MAXDo est dans les mains de la WCG. Les unités de calcul seront délivrées très bientôt.

HCMD2 étudiera, par cross docking, 2246 structures protéiques chez l'homme. Au total, nous avons à "docker" 2246x2246 interactions possibles. Cela signifie que 913 627 781 945 positions initiales de docking devraient être calculées par un cross-docking complet. Avec JET (qui prédit les interfaces protéine-protéine), nous allons réduire l'espace de docking de 87%, c'est-à-dire que MAXDo aura seulement 118 771 611 652 conformations à analyser. Cela rend le calcul faisable sur la WCG! Nous vous remercions par avance pour le temps de calcul que vos machines lui dédieront!!

L'ensemble des 2246 protéines qui seront dockées contient toutes les protéines connues pour jouer un rôle dans les maladies neuromusculaires (MN). Dans l'ensemble complet, la vaste majorité des autres protéines sont des cibles potentielles de l'ensemble des MN et, dans le projet, nous allons évaluer les interactions potentielles entre elles.

Vous pouvez trouver les informations sur le travail que nous avons conduit ces derniers mois à l'adresse http://www.ihes.fr/%7Ecarbone/HCMDproject.htm

En attendant de travailler avec vous très bientôt de nouveau.

Très cordialement.

Alessandra

Dans son message, veillez noter cet adresse : http://www.ihes.fr/~carbone/HCMDproject.htm , nous essaierons de vous en apporter la traduction dès que possible !

Merci à ALAIN_13013 pour avoir fait remonter l'information !