Phase 2 du Décrypthon, 1, 2, 3 c'est parti !

Alessandra Carbone nous laisse un message depuis le forum WCG :

Bienvenue dans la seconde phase du projet Lutte contre les Dystrophies Musculaires (HCMD2).
Afin de comprendre comment les protéines remplissent leur fonction biologique dans les cellules, il est nécessaire de mieux comprendre en détail les modes d'interactions entre protéines dans le but d'aider les chercheurs à développer de nouvelles stratégies thérapeutiques.
HCMD2 va analyser une large base de données de protéines humaines et passer celles-ci au crible afin de chercher parmi elles des partenaires protéiques potentiels in vivo. Une partie des 2200 structures protéiques que votre ordinateur va contribuer à analyser concerne des molécules impliquées dans les dystrophies musculaires, une autre partie des ces protéines joue un role important dans divers tissus ou organes comme le coeur ou le cerveau. La première phase du projet nous a permis de développer et tester une méthode qui permet de discriminer les partenaires protéiques des paires de protéines qui n'interragissent pas ensemble (à partir d'un ensemble dont les interactions expérimentales sont connues). La seconde phase va appliquer cette méthode numérique à des protéines dont on ignore les interactions afin de découvrir de nouveaux partenaires potentiels. Chaque unité de calcul résolue durant la phase 2 nous apportera des informations sur le mode d'interaction de deux protéines parmi les 2200 étudiées.
Votre contribution à ce projet apportera des informations importantes aux biologistes et aux physiciens, et à terme bénéficiera à tous les chercheurs qui travaillent sur des maladies génétiques et en particulier les maladies neuromusculaires. Au final nous espérons contribuer au développement de thérapies innovantes qui aboutiront à un traitement de la grande majorité des maladies neuromusculaires, y compris les dystrophies musculaires.
Beaucoup d'entre vous ont déja résolu des unités de calcul lors de la première phase du projet, qui a été un succès et nous a beaucoup appris. Une grande partie de ce succès revient naturellement aux participants de la phase 1. Avec le démarrage de la phase 2, nous souhaiterions remercier tous les gens qui apportent leur contribution à HCMD2 en donnant du temps de calcul au projet et à World Community Grid.

Ce pojet est soutenu par le programme Decrypthon (un partenariait AFM/IBM/CNRS) et l'Université Pierre et Marie Curie.