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Lutte contre la dystrophie musculaire, bientôt la phase 2

Nous l'attendions tous avec impatience, nous devrions être comblé d'ici le mois d'avril 2009.
Le projet de "Lutte contre la dystrophie musculaire", qui était en pause depuis presque 2 ans (Juin 2007 pour la dernière unité).

Alessandra Carbone nous délivrait ce message hier annoncant la reprise imminente du projet en phase 2.

Voici son message :

Chers tous,

Nous sommes arrivés au moment du lancement de la deuxième phase du projet Help Cure Muscular Dystrophy (HCMD2). La World Community Grid (WCG) estime que le projet débutera mi-avril 2009. Nous avons, de notre côté, terminé tout ce que l'on souhaitait et MAXDo est dans les mains de la WCG. Les unités de calcul seront délivrées très bientôt.

HCMD2 étudiera, par cross docking, 2246 structures protéiques chez l'homme. Au total, nous avons à "docker" 2246x2246 interactions possibles. Cela signifie que 913 627 781 945 positions initiales de docking devraient être calculées par un cross-docking complet. Avec JET (qui prédit les interfaces protéine-protéine), nous allons réduire l'espace de docking de 87%, c'est-à-dire que MAXDo aura seulement 118 771 611 652 conformations à analyser. Cela rend le calcul faisable sur la WCG! Nous vous remercions par avance pour le temps de calcul que vos machines lui dédieront!!

L'ensemble des 2246 protéines qui seront dockées contient toutes les protéines connues pour jouer un rôle dans les maladies neuromusculaires (MN). Dans l'ensemble complet, la vaste majorité des autres protéines sont des cibles potentielles de l'ensemble des MN et, dans le projet, nous allons évaluer les interactions potentielles entre elles.

Vous pouvez trouver les informations sur le travail que nous avons conduit ces derniers mois à l'adresse http://www.ihes.fr/%7Ecarbone/HCMDproject.htm

En attendant de travailler avec vous très bientôt de nouveau.

Très cordialement.

Alessandra

Dans son message, veillez noter cet adresse : http://www.ihes.fr/~carbone/HCMDproject.htm , nous essaierons de vous en apporter la traduction dès que possible !

Merci à ALAIN_13013 pour avoir fait remonter l'information !

Sources :
www.worldcommunitygrid.org/forums

3 commentaires

Super_baloo8 a écrit :

Les bêta test sont en place ? On le saura avec le temps !

07 Mars 2009 à 17h52

tomcat4ever a écrit :

oui je confirme, super chouette même

25 Février 2009 à 13h24

Super_baloo8 a écrit :

Chouette !

25 Février 2009 à 12h18

Écrit le 25 Février 2009 à 09h30 par Super_baloo8

The Clean Energy Project, fin des unités de travail de type A

Les calculs de type A du projet de calcul partagé "The Clean Energy Project" sont maintenant terminés.

D'ici quelques temps, les calculs de type B devraient être envoyés. Il seront envoyés une fois sur le réseau de manière tout à fait normal, mais aussi sous forme de calcul "bêta". Ainsi, si les résultats croisés correspondent, le projet "The Clean Energy Project" pourra lancer sereinement leur calcul de type B.

Merci ALAIN_13013 pour l'information !

Sources :
www.worldcommunitygrid.org/forums

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Écrit le 18 Février 2009 à 14h45 par Super_baloo8

Changement d'hébergement du site Grid-France.fr

Bonjour à toute et à tous !

Aujourd'hui est un grand jour, notre site et notre forum vont déménager. Nous allons vers un hébergement bien plus performant que l'actuel, puisque nous passons d'une solution d'hébergement mutualisé, à une solution d'hébergement dédié !

Ce changement ce fera aujourd'hui.

Il débutera aujourd'hui vers 13h, pour se finir ce soir dans la nuit. Pendant ce temps, le site et le forum resteront accessibles en lecture uniquement.

Nous nous excusons d'avance pour la gène occasionnée.

L'équipe technique Grid-France.fr

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Écrit le 13 Février 2009 à 09h52 par Super_baloo8

Votre PC peut aider à lutter contre le SIDA/HIV !

Lutte de journée contre le Sida

=> Seulement 10 à 20 % des capacités de votre ordinateur sont réellement utilisées,
même lorsque vous travaillez avec !!!

Le programme de "calcul partagé" World Community Grid permet de mettre les 80% restants au service de la recherche à but humanitaire, automatiquement et sans impacter la performance de votre outil.

En cette journée mondiale de lutte contre le SIDA/HIV, je vous invite donc à :
- enregistrer votre ordinateur au programme World Community Grid de la Fondation IBM,
- re-router cette information vers vos collègues, amis, clients, partenaires ...
... et aider les chercheurs du programme FightAIDS@Home à trouver plus rapidement de nouveaux médicaments plus efficaces contre le SIDA.



Merci aux 4 200 employés d'IBM France déjà inscrits, et aux 22 000 internautes solidaires en France !
=> pour s'inscrire : http://www.worldcommunitygrid.org

Sources :
www.worldcommunitygrid.org/

2 commentaires

1983max a écrit :

et moi aussi j'y suis déjà :)

Par contre leur publicité pour rejoindre WCG via la journée mondiale contre le SIDA est une bonne idée et pourquoi ne pas reprendre l'idée et faire comme une chaine avec les infos de l'équipe france pour rejoindre les projets que l'on défend ?!

03 Décembre 2008 à 21h37

Super_baloo8 a écrit :

J'y suis déjà :P

02 Décembre 2008 à 20h50

Écrit le 01 Décembre 2008 à 13h11 par Super_baloo8

L'appel à la révolte des chercheurs français

La grogne et le mécontentement du monde scientifique à l’égard de la politique du gouvernement montent d’un cran. L’ensemble des syndicats appelle à deux jours de grève et de manifestation, le 20 novembre avec le monde enseignant mais surtout le 27 novembre. Motif : arrêter le démantèlement du système de recherche français.

Se mobiliser, batailler, lutter, résister, se révolter… Les communiqués syndicaux publiés ces derniers jours par les syndicats de la recherche et de l’enseignement supérieur donnent le ton. Il faut agir vite et frapper fort pour refuser l’éclatement du Centre national de la recherche scientifique (CNRS) et des autres organismes de recherche, expliquent les syndicats. Un appel unitaire à la grève est lancé pour le 27 novembre, jour du conseil d’administration du CNRS.

Déjà orageux, le climat entre le gouvernement et le monde scientifique s’est encore détérioré depuis la remise, par l’Agence d’évaluation de la recherche et de l’enseignement supérieur (Aeres), du rapport sur l’Inserm, dont certaines recommandations ont été reprises par le Premier ministre le 14 novembre, lors des 120 ans de l’Institut Pasteur. François Fillon a confirmé «la volonté du gouvernement de voir évoluer le secteur de la recherche biomédicale».

Cette évolution, d’après les recommandations des experts dirigés par Elias Zerhouni, qui vient juste de quitter la direction des NIH (National Institutes of Health, USA), va vers la création d’un «institut national unique pour la recherche dans le domaine des sciences de la vie et de la santé». «Le mélange et l’abondance actuelle d’institutions de recherche nationales […] nécessitent des mesures radicales de restructuration» stipule le rapport. Au-delà de l’Inserm, c’est donc un pan entier du CNRS qui est concerné. Sachant que deux autres commissions ont été chargées par Valérie Pécresse, ministre de la recherche, de rendre des rapports sur les sciences de la vie et sur l’informatique, les chercheurs craignent que le CNRS soit purement et simplement démembré.

Ces craintes ne datent pas d’hier (lire Le CNRS sur ses gardes). Il y a quelques mois, les chercheurs dénonçaient déjà un renforcement du pilotage de la recherche par le ‘’haut’’. Transférée aux universités, qui sont étroitement liées aux pouvoirs politiques régionaux, la gestion des équipes de recherche sera moins indépendante, expliquent les représentants syndicaux. Les chercheurs craignent que quelques grandes universités, celles qui feront de la recherche, récoltent des moyens, au détriment des plus petites.

La commission d’évaluation sur l’Inserm veut mettre fin à la fragmentation et à l’éparpillement des sources de financement, qui contraignent les chercheurs à de lourdes tâches de paperasseries. Cependant cette fragmentation a été aggravée par les réformes récentes, notamment la création de l’ANR, ou encore la création de 10 instituts, avec chacun son outil de coordination, au sein de l’Inserm. «La complexité des sources de financement est exacerbée par la prolifération d'initiatives spéciales, comme les regroupements thématiques (RTRA, RCTRS, génopôles, canceropôles, infectiopôles) qui entraînent des complications administratives supplémentaires et qui captent les ressources locales encore davantage» peut-on lire dans le rapport.

Etendant ses recommandations assez loin, le comité d’experts piloté par Zerhouni recommande de repousser l’âge de la titularisation des chercheurs, en créant une « période préparatoire » de 5 ans minimum.

Eclatement du CNRS, suppression de 900 emplois, faiblesse budgétaire, développement de la précarité de l’emploi, réforme contestée du statut d’enseignant-chercheur.. La liste des griefs s’allonge du côté des chercheurs. Et le ton de la mobilisation n’est pas sans rappeler d’il y a quatre ans, qui avait débouché sur la tenue des Etats généraux de la recherche. Un travail de réflexion et de propositions qui devaient servir à la réforme du système de recherche français. Mais que les chercheurs reprochent au gouvernement de n’avoir jamais utilisé.

Sources :
tempsreel.nouvelobs.com/actualites

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Écrit le 22 Novembre 2008 à 21h41 par 1983max

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