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Bienvenue à tous les participants du forum et les lecteurs, nous vous souhaitons une bonne balade en notre compagnie. N'hésitez pas à laisser vos impressions quelque part sur le forum ou sur notre livre d'or. Vous avez des questions ? Vous souhaitez les poser ? Ne vous gênez pas, nous sommes là pour ça !

#1 Attribuer +128/02/2013 21:03:31

ALAIN_13013
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Nouveau projet BOINC - FightMalaria@Home

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#2 Attribuer +128/02/2013 22:02:58

Yeti_73
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Re: Nouveau projet BOINC - FightMalaria@Home

Merci pour ta veille  Merci
Ça tourne déjà chez moi...

PS : tu postes sur le forum des modo., tu ne veux pas informer tout le monde ?



Je peux résister à tout, sauf à la tentation.

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#3 Attribuer +128/02/2013 22:38:17

ALAIN_13013
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Re: Nouveau projet BOINC - FightMalaria@Home

Yeti_73 a écrit :

Merci pour ta veille  Merci
Ça tourne déjà chez moi...

PS : tu postes sur le forum des modo., tu ne veux pas informer tout le monde ?

Message d'origine

C'est vrai Yeti, je préfère m'assurer que les résultats de ces recherches seront bien dans le domaine public, avant de diffuser sur le forum.

C'est encore le cas ici About FMAH je déplace donc la discussion.

FightMalaria@Home project a écrit :

About FMAH
About the FightMalaria@Home project
We are developing a distributed computation strategy for docking known hit compounds into models of malarial proteins to build a ranked list of novel targets for further investigation.
The main focus is on discovering novel therapeutic drugs. Initially we will screen all hit compounds against all models of plasmodial proteins. This should provide a list of potential new target proteins that will need further investigation and validation in the laboratory. Once these targets have been validated, resources can be focused on finding effective inhibitors and developing new 'first-in-class' drugs. We will need help from many research groups around the world for this important validation step, so all our data will be made freely available online.
To answer our first question we will need to perform over 300 million docking calcuilations. This will clearly require staggering computational resources, thus the need to utilise the world’s ‘spare’ idle CPU resources. BOINC is a well established system for donating spare computation time (Sony even distribute BOINC as standard with new VAIO computers).
The precedent has been set with fightHIV@home, Africa@home, GoFightAgainstMalaria and many other distributed computation programs. The pieces of the puzzle are readily available, including publicly available proteome information (Integr8), hit lists (MMV, ChEMBL), X-ray crystal structures (PDB), models of malarial proteins using MODELLER or DISTILL, compound libraries (ZINC, PubChem), docking programs (AutoDock VINA, eHiTS), and distributed computing software (BOINC). The challenges now involve connecting these pieces together, and getting the public involved.

All data will be made freely available on our website and (hopefully) on the Tropical Diseases Initiative website to help encourage other 'wet-lab' researchers to test the suggested compound-protein interactions and hopefully confirm these novel targets.

Many thanks to Aniko Simon of SimBioSys who has customised their eHiTS docking program for the FightMalaria@Home project.
Future funding will be sought from charitable organisations such as the Bill and Melinda Gates foundation to validate the compound-target interactions.  An added benefit of having available computational power is that we may also be able to suggest potential ligands for previously uncharacterised hypothetical proteins - labelled ‘putative’ in the proteome annotation.

Toutes les données seront librement disponibles sur notre site Web et (si tout va bien) sur le site Web Initiative de Maladies Tropical pour aider à encourager d'autres chercheurs à examiner les interactions suggérées de composé-protéine et à confirmer si tout va bien ces nouvelles cibles.


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#4 Attribuer +101/03/2013 06:16:18

boulmontjj
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Re: Nouveau projet BOINC - FightMalaria@Home

Et un de plus dans cette équipe.

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#5 Attribuer +101/03/2013 10:00:03

gridained
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Re: Nouveau projet BOINC - FightMalaria@Home

C'est parti pour moi aussi !  plus1


Future is in crunching !
ma production photovoltaique: http://tsmi10.free.fr/PV

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#6 Attribuer +101/03/2013 13:43:59

satanson
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Re: Nouveau projet BOINC - FightMalaria@Home

C'est parti !!  plus1

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#7 Attribuer +101/03/2013 13:57:06

boulmontjj
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Re: Nouveau projet BOINC - FightMalaria@Home

C'est qu'il a du succés ce nouveau projet.  35

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#8 Attribuer +102/03/2013 09:26:47

ALAIN_13013
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Re: Nouveau projet BOINC - FightMalaria@Home

Nous allons à l'instar des projets déjà soutenus par Grid-France, créer un badge pour ce gargariser le fond du gosier de  servez-vous  régulièrement.
40 Avant tout il nous faut une image,le site du projet ne propose pas de logo ou badge.
L'image doit être simple et reconnaissable à l'échelle du format de nos badge.


Merci de proposer vos idées de badge


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#9 Attribuer +102/03/2013 09:55:57

boulmontjj
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Re: Nouveau projet BOINC - FightMalaria@Home

J'y ai déja pensé ce matin et je n'ai rien trouvé à part l'icone dans la barre de navigation qui pourrait être pas mal.
Par contre, pour mettre en place les badges, faudrait que Sylvain nous dise comment ça se passe carpour l'instant, c'est toujours lui qui a fait.

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#10 Attribuer +102/03/2013 10:16:55

ALAIN_13013
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Re: Nouveau projet BOINC - FightMalaria@Home

boulmontjj a écrit :

J'y ai déja pensé ce matin et je n'ai rien trouvé à part l'icone dans la barre de navigation qui pourrait être pas mal.
Par contre, pour mettre en place les badges, faudrait que Sylvain nous dise comment ça se passe carpour l'instant, c'est toujours lui qui a fait.

Message d'origine

Nous avons un tuto, mais c'est pour les administrateurs pelle pas pour les modérateurs.


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#11 Attribuer +102/03/2013 12:29:16

Yeti_73
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Re: Nouveau projet BOINC - FightMalaria@Home

Un montage...

http://www.grid-france.fr/forum/img/uploads/miniature/379_fmh.png


http://www.grid-france.fr/forum/img/uploads/379_fmh.png



Je peux résister à tout, sauf à la tentation.

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#12 Attribuer +102/03/2013 15:31:35

ALAIN_13013
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Re: Nouveau projet BOINC - FightMalaria@Home

plus1 j'aime bien très belle idée  43


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#13 Attribuer +102/03/2013 15:33:54

satanson
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Re: Nouveau projet BOINC - FightMalaria@Home

plus1

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#14 Attribuer +102/03/2013 16:21:58

olivthecat
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Re: Nouveau projet BOINC - FightMalaria@Home

bzzzzzzzzzzzz   salle bête

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#15 Attribuer +102/03/2013 20:20:01

boulmontjj
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Re: Nouveau projet BOINC - FightMalaria@Home

plus1 aussi.
Très bon travail et très bonne proposition Yéti 35

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